產業概況：
- 養豬產業
由全球的觀點來看，中國大陸、美國和歐盟是主要的豬肉生產地區，我國2000年及2001年都維持在91萬公噸左右，約佔全球總產量的1%。以豬肉的消費量而言，仍是中國大陸、歐盟和美國居前三位；出口量最高的則依序為歐盟、加拿大和美國。2001年我國的豬肉進口量只1萬5千公噸，而自1997年爆發口蹄疫後並沒有出口。2001年我國的豬隻屠宰頭數約為1千萬頭，雖然養豬產業遭受到WTO的衝擊，但短期內飼養頭數還不至於銳減，主要係因為豬肉進口配額管制尚未完全開放。雖然我國豬隻的生產成本為歐美的1.2∼1.7倍，但進口豬肉的成本再加上稅金及運費後，相較於歐美，我國如能有效再提升效率及降低通路成本，則仍勉強具有競爭力。根據我國動物科技研究所資料顯示，養豬直接成本2001年為3,800元/百公斤，而拍賣價格平均為3,997元/百公斤，所以養豬戶仍有些許利潤，長期來看，經營效率良好的養豬場仍可留存下來，供應本土的需求。
- 草食家畜
未來我國的生牛乳產量應在34萬公噸左右，但是國內生牛乳的生產成本幾乎是美國的兩倍，所以產量有可能在2005年之前下降到30萬公噸。目前一般消費者較難接受國外進口的保久乳，所以國內業者仍有其基本的生存空間，但長期而言，在成本壓力及國外產品價格競爭下，生存空間將會變小。我國國產牛肉產量很少，約只佔國內需求的8.16%，目前國內牛肉佔有率以澳洲佔最多(約50%)，其次為紐西蘭(23∼25%)和美國(約20%)。目前國產牛肉每公斤約80元，一般以鮮牛肉出售，其消費者為特定族群，與進口之冷藏或冷凍牛肉的消費族群有所區隔。
- 家禽產業
禽肉和雞蛋一直是我國飲食中不可或缺的主角之一。2001年我國禽肉的生產略升為72萬公噸，其中63萬公噸為雞肉。因近年生產成本已高於稅後盈餘；以2000年為例，生產成本為3,216元/百公斤，而平均出場售價為34元/公斤，稅後每百公斤損失23元。再加上進入WTO全面開放進口的衝擊，我國的肉雞勢必面臨離牧或合併的命運。雞蛋和鴨蛋近兩年的產量約維持雞蛋77億顆，鴨蛋5億4千顆。2000年雞蛋的生產成本約為20元/公斤，而平均售價才22.5元/公斤。預期往後仍會面臨生產過剩及價格偏低的困境，所以有待政府輔導。二，新興畜禽生物技術產業現況
最近三年，因政府大力推動形成生物技術產業的各項措施，已有200餘家的生物科技公司的成立，其中與畜禽生技產業相關的有47家，然而以研發和生產畜禽為主軸產品的公司僅有下列11家：
學術及研究機構：
疾病診斷技術