色素（pigment）是形成色彩的化合物，因為它們會吸收可見光譜範圍 (波長400-800nm )之內的光，不同的色素根據其特殊的化學結構以獨特的形式呈現色彩。不同種類的色素決定了植物的葉、花和果實的顏色，例如脂溶性的葉綠素(chlorophylls)、類胡羅蔔素 (carotenoids) 以及水溶性的葉黃素 (flavonoids)。

光合作用 (photosynthesis) 是綠色植物利用光能，在葉綠體中將二氧化碳、水和無機物造成有機養料的作用，其中包括光能的吸收、能量轉換，故光合作用是一種將光能轉變成化學能的作用。而在植物中負責吸收光能的分子即是色素。

葉綠素a和b提供呈現綠色，而吸收紅、藍光以提供光合作用所需的光能，其中葉綠素a是主要參與光反應的色素，故稱為主色素；其餘如葉綠素b、類胡蘿蔔素、葉黃素功能在輔助吸收光能再傳遞給葉綠素a進行光化反應，因此這類色素稱為輔色素。此外，類胡蘿蔔素具有保護葉綠素以防止光氧化的作用。

光合作用色素通常存在於葉肉細胞的葉綠體內，在化學性質上他們是屬於脂溶性的化合物，因此容易溶於有機溶劑，而在這個實驗中我們將用丙酮溶液來研磨植物組織，以萃取出色素。進一步利用薄層色層分析法 (TLC) 來分離各種色素化合物。另外以分光光度計測定色素溶液的不同波長吸光值。