Transposition 是指一段DNA從染色體上特定的位置移轉到另一個位置過程,這個過程中,除了DNA以外,尚須有許多的蛋白質一起合作才得以完成而其中相當重要的一種蛋白質便是 transposase。Tn5 便是一種transposase,主要功能在於使要轉移的DNA片段由原本的DNA上切下。這裡所要介紹的,是Tn5 inhibitor,雖然和Tn5在絕大部分結構很類似,但會抑制Tn5 dimer 的產生,也抑制了transposition 的發生。

    Tn5 inhibitor 共由421個氨基酸所組成,只比Tn5少了最前面的55個氨基酸,而且其序列與Tn5的 Met56-Ile476完全一樣。Inhibitor 的模型由Ser70 開始到Gln472結束,主要可分為兩大部分:catalytic domain和 C-terminal dimerization domain

Catalytic domain 從Ser70 到Gln365,是由7條alpha-helices和9條belta-sheet所組成,active site 位在Asp97, Asp188, Glu326和Arg322間,主要功能在於切斷DNA片段。

C-terminal dimerization domain則位於Leu366到Gln472,由5個alpha-helices組成,主要用作inhibitor之間dimer的形成或與Tn5結合。


spin off
spacefill
show stucture
backbone
reset
function of Tn5 inhibitor


Primary Citation:
Davies, D. R., Braam, L. M., Reznikoff, W. S., Rayment, I.: The Three-Dimensional Structure of a Tn5 Transposase-Related Protein Determined to 2.9 ?Resolution. J. Biol. Chem. 274 pp. 11904 (1999) [full text] [PDF]