RasMol 是一個分子圖形軟體, 可用以檢視各種化學小分子、蛋白質,
或核酸分子等。 RasMol 讀取描述分子立體結構的原子座標檔,
將分子的立體結構, 藉由生動的顏色及模型,
以互動的形式展現在電腦螢幕上; 所產生之高品質的分子圖形,
無論是在教學或研究上, 都是非常重要的工具。
這是 RasMol 程式介面的 圖形視窗, 及 指令視窗 的大致外觀
(在不同機器上, 可能略有不同)。 圖形視窗 中, 所顯示的是血紅蛋白
(2hhd.pdb), 經過 RasMol 的一些指令處理後, 所得之圖形。
RasMol 程式介面有兩個視窗:
- 圖形視窗: 這是分子模型顯示的視窗, 在此視窗中,
可利用滑鼠來檢視分子模型 (縮小、放大、轉動、移動等),
並可點選選單中一些預設的常用指令, 以得到所要的分子模型。
- 指令視窗: 對於比較複雜進階的分子模型處理,
則必須由 指令視窗中, 輸入指令。
利用 RasMol 可以將抽象的分子, 建立起立體模型, 由不同的角度來檢視。
尤其對複雜的生化分子, 蛋白質、核酸等, 經過適當的顏色或模型的標記,
有助於瞭解大型分子的各級結構、分析活性區的作用力等。
在這裡, 我們展示一些 RasMol 所建立的分子模型圖檔 ([ ] 內則是 pdb 檔):
咖啡因 (caffeine)
[咖啡因 pdb 檔]
阿司匹靈 (aspirin)
[阿司匹靈 pdb 檔]
膽固醇 (cholesterol)
[膽固醇 pdb 檔]
維他命 B12(vitamin B12)
[維他命 B12 pdb 檔]
血紅蛋白(hemoglobin)
[血紅蛋白 pdb 檔]
上面 GIF 圖檔, 僅是 RasMol 介面之圖形顯示說明, 並不具有互動之功能。
(如欲在 WWW 瀏灠器中, 以互動的形式檢視分子, 可以利用
Chime 安插程式)
RasMol 是一個簡單、易學、好用的軟體, 可以馬上
安裝 在你的機器上。
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